基于电子捕获裂解 / 电子转运裂解串联质谱技术的蛋白质组学研究

基于电子捕获裂解 / 电子转运裂解串联质谱技术的蛋白质组学研究 *
孙瑞祥 1)** 董梦秋 2)** 迟   浩 1) 杨   兵 2) 秀丽蕴 1) 王乐珩 1) 付   岩 1) 贺思敏 1)
( 1) 中国科学院计算技术研究所,智能信息处理重点实验室,北京 100190; 2) 北京生命科学研究所,北京 102206)

[摘要]

   蛋白质组学的兴起带动了质谱技术的快速发展,而质谱技术的进步则拓宽了蛋白质组学研究问题的广度. 最近 10 年内,肽段或完整蛋白质在质谱仪中的裂解技术———电子捕获裂解(electron capture dissociation, ECD)与电子转运裂解(electrontransfer dissociation, ETD)逐渐发展起来. ECD 和 ETD 在蛋白质组学中的应用,特别是在蛋白质的翻译后修饰鉴定和“自顶而下(Top-down)”的完整蛋白质裂解研究中已经展示出了诱人的前景. 对 ECD 和 ETD 的基本原理、质谱特点、仪器实现、数据解析算法与软件开发,以及在蛋白质组学中的应用进展等方面进行了比较系统全面的阐述,并对当前的研究问题、面临的技术挑战与未来的发展趋势等方面作了深入剖析.

关键词   电子捕获裂解,电子转运裂解,碰撞诱导裂解,串联质谱技术,计算蛋白质组学

生物化学与生物物理进展
Progress in Biochemistry and Biophysics
2010, 37(1): 94~102   新技术讲座

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