随着世界老年人口数量不断增加，护理需求、衰弱状态、痴呆症等健康问题也日益凸显；而发达国家正面临人口老龄化带来的劳动力减少、社会保障支出增加等挑战。为应对这些问题，开展旨在延长健康预期寿命的研究已迫在眉睫。

本文使用岛津高分辨质谱仪（配备 *Nexera Mikros™的 LCMS-9050），结合二代测序，对长寿型黑腹果蝇与其野生型果蝇进行了对比研究。在 DNA 分析中，通过全基因组测序检测到 83 万个单核苷酸变异 / 插入缺失（约 4 万个结构变异）；在 RNA 分析中，全面表达分析检测到 185 个 P 值≤0.05 的位点。通过全面蛋白质分析鉴定出约 1000 种蛋白质，广泛靶向分析检测到约 300 种代谢物。最后将这些结果整合到岛津多组学分析方法包中，用于长寿机制研究。

岛津LCMS-9050高分辨质谱仪+多组学分析软件

岛津高分辨质谱LCMS-9050——更高的质量数准确度、稳定性

LCMS-9050采用了岛津独立研发的新技术，可实现高精度温度控制，以及出色的质量准确度、高灵敏度和高分辨率；200Hz（200张谱图/秒）的超高速图谱采集速度可以优化DDA/DIA工作流，实现复杂体系下的高通量高分辨分析。

本文中Mikros-9050 DDA获得的蛋白数据如图(Fig 5)，数据分析采用 PEAKS Studio X Pro 软件（Infocom 公司）。

首先，通过 “从头测序”（de novo sequencing）功能，依据串联质谱（MS/MS）的质量峰列表计算出肽段的氨基酸序列（包括翻译后修饰）。仅在野生型中检出的肽段数量为 963 个，仅在突变型中检出的肽段数量为 1148 个，两者共有的检出肽段数量为 3666 个（Fig 6）。

Fig 7 展示了匹配为对应蛋白质肽段的整合肽段得分。野生型与长寿型果蝇的肽段得分分布无显著差异，表明本次检测与分析结果均良好。

岛津数据分析软件—多组学分析方法包&代谢组学分析数据库

在蛋白质组学研究中，当我们检测 DNA、RNA、代谢物等物质时，有时会得到与蛋白质组学研究预期不符的结果。而且通过绘制火山图等统计分析手段，我们可推断样本组在上游（DNA、RNA 层面）或下游（代谢物、表型层面）的差异。借助岛津多组学分析包，可对目标代谢物进行分析时同步分析其相关代谢通路；并且结合多种统计分析方法，例如，将主成分分析结果映射到代谢通路图上（Fig 14）。

相较于传统方法，无需单独分析二代测序的数据，通过优化分析减少变量——蛋白质和代谢物(有机酸、糖、核酸、脂肪酸、氨基酸等结合的结果)，缩短了下一代测序仪结果的分析时间。（Fig 12）。

小结：

本文结合二代测序仪和液相色谱-质谱系统（LCMS-9050），将黑腹果蝇野生型与长寿型基因突变进行比较。结合岛津多组学分析方法包，将相关DNA、RNA、蛋白质和代谢物数据进行整合分析，且同步分析代谢途径，促进了多组学分析发展。同时观察到长寿型果蝇体内色氨酸通路受到抑制，在 DNA 和 RNA 层面均检测到朱红色眼基因座（Vermillion locus）的插入突变。下一步可以开展富集分析，以及蛋白质组学中的数据非依赖采集（DIA）检测研究。

*Nexera Mikros™流量范围（1 - 500 μL/min），在与LCMS联用检测目标化合物时可以获得更高的灵敏度、更短的分析时间和更好的稳定性，是岛津LC 家族重要成员。

注：

• 应用文引自岛津全球应用报告Application Note.98

• 文中所涉方案及产品非医疗用途，仅供科研研究参考

本文内容非商业广告，仅供专业人士参考。